故事发生在星之海学园中，表面看来，乙坂有宇（内山昂辉 配音）不过是一个平凡的少年，然而，实际上，他拥有着能够夺取他人身体的超能力。这么多年来，乙坂依靠着自己的超能力平安度日，当他以为平静的日子将会在崭新的校园里继续之时，名叫有利奈绪（佐仓绫音 配音）的少女出现在了他的面前。 奈绪亦是一名超能力携带者，她能够对特定的某一人隐身。除此之外，能够瞬间移动的高城丈士朗（水岛大宙 配音）、能够招来死去的姐姐黑羽美砂（内田真礼 配音）的灵魂的校园偶像黑羽柚咲（内田真礼 配音），当这些少年少女们在无名之力的牵引之下聚在一起时，命运的车轮开始了旋转。
2000年。在长野山中的九郎岳，正在进行某座神秘遗迹的挖掘工作，遗迹内的一具棺木中藏有一个佩戴石化腰带的古尸。 孰不知当调查团将棺木开启时，亦因此唤醒了它的死敌『古郎基』。调查团立即遭到未确认生命体的袭击而全数死亡。而在为了查出调查团被杀案件的线索，正在遗迹现场调查中的长野县刑警一条薰面前，有一名青年突然擅自闯入。这名被一条拦下的青年，他自称为冒险家五代雄介。 终于复活的未确认生命体在长野近郊出现，并开始对人们恣意袭击，甚至一路冲进警局。在场的雄介感应到从遗迹出土，由警方保管的腰带状遗物所传来的战士形象，在冒险家的直觉下将之着装于腰部。雄介的身体也随之覆上一层装甲，变身后的雄介与袭击警局的未确认生命体经过一场苦战后终于将其击倒。 随着未确认生命体不断出现于大城市东京， 五代雄介下定决心为了让周遭的人们免于恐惧，守护他们的笑容而战…… 新一代假面骑士『空我』诞生！
少年牧真人（山时聪真 配音）的母亲葬身火海后，他随父亲牧胜一（木村拓哉 配音）与继母夏子（木村佳乃 配音）组成新家庭。深陷悲伤的真人阴郁孤僻，难以融入新环境。一次意外，他跟随一只会说话的苍鹭（菅田将晖 配音）闯入废弃的神秘塔楼，却不料进入了奇幻的“亡灵世界”，开始了一场不可思议的冒险…… 影片片名致敬了小说家吉野源三郎在1937年发表的同名小说，但电影故事由宫崎骏原创。
