基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象：森林树木变得更茂密，湖泊海洋闪发着光，电力强化导致设备爆炸。由于基因源事故，武装战士变成变形机甲、生物进化为虫族、浩肯星人异化为变异战士，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
影片故事改编自巴基斯坦的古老神话，主人公阿拉亚是个勇敢、自信、正义的小男孩，在拯救了一只捻角山羊后，拥有和动物说话的能力，在护送捻角山羊回家的路上与盗猎者、狼群斗智斗勇；而中国喜马拉雅地区特有的动物雪豹作为主要角色之一，帮助主人公战胜盗猎者；“敬人者，人恒敬之”“患难与共”等中国典故贯穿始终。
一个7岁小男孩马丁，每天早晨醒来后，都会发现自己变身不同角色。他就是百变马丁。有时，他是勇敢的超人；有时，他是聪明的发明家；有时，他是可爱的稻草人。在好朋友郭莫、罗娜的帮助下，他们克服一切困难，展开每一段跌宕起伏的有趣故事，陪伴我们度过一段异想天开的美好时光。
