正魔大战已过去十年，张小凡化身鬼厉，在魔教内斗中征伐四方。此时死亡沼泽异宝出世，引得各方势力争夺，鬼厉与陆雪琪重逢，两人陷入了更深的爱恨纠葛。后鬼厉因下属失踪一事追查至焚香谷，意外救出九尾天狐小白，获得古巫族线索，最终鬼厉在历经九死一生后，终求得掌握招魂奇术的大巫师答应前往救治碧瑶，十年夙愿，究竟结果如何……
女娲娘娘为了造福人间，创造出了能够帮助人类的神兽，哪知道邪恶而又贪婪的元始天魔利用了善良的神兽，将它们污染变为了残暴的魔兽，驱使它们祸害人间，企图就此成为统治世界的霸主。 问天（马小冀 配音）是南宫城城主的儿子，一次偶然之中，他得到了神兽天晶兽（王凯 配音），让问天没有想到的是，天晶兽竟然幻化成为了神兵，拥有着足以打败魔兽的强大力量。与此同时，问天的妹妹问雅（刘旭莹 配音）从母亲的血脉里遗传了净化之力，能够净化遭到黑暗力量侵蚀的神兽，在兄妹两人无间的配合之下，正义的势力逐渐的壮大起来。元始天魔眼看阴谋无法得逞，于是召唤出了更加强大的敌人玄天邪帝。
《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
狐妖蛊惑书生的风波平息后，神都恢复了以往的繁华与喧闹，武后心情大好，决定举办一场盛大的秋猎，邀请王公贵族和民间擅长武艺的能人共聚一堂，切磋骑射。 吐谷浑小可汗慕容纪也受邀参加秋猎，却阴差阳错的成了一场行刺武后阴谋的“嫌疑人”。走投无路的慕容纪只得向裴坤求助，希望他能帮忙找出真凶，洗清自己的冤屈。为保大唐国泰民安，也为帮助好友，裴坤和尉迟柱、韩冬青等伙伴再次联手查案，一路险情和笑料不断，终于追查到了谋刺武后的真凶，阻止了一场大唐与吐谷浑之间的战争。
