天赋异禀的灵宠师樊凌霄，于甲级门派晋升赛上遭人暗算，被自己的灵鲲所吞噬。睁眼醒来却发现自己已化身为一名叫“流锋芒”的少年，身处白府大牢之中，其门派凌霄阁也走到了绝境。为查明灵鲲反噬真相与重振门派，樊凌霄带着现有的几只灵宠，与谷灵、程曦、月彤，一起踏上了全新的冒险之旅。
蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。 哪知道，魔力宝石的秘密给邪恶的哈莱王后给知道了，哈莱王后非常 想要得到宝石，于是派出了自己的儿子奥玛。奥玛隐藏了真实身份，假装成一个平凡的普通人类接近小蓝一行人，在对方放松警惕后最终成功的夺走了宝石。哈莱王后利用宝石的力量开始向魔仙堡发起进攻，在魔仙堡腹背受敌的情况下，小蓝、美琪和美雪及时赶到，以正义的力量战胜了邪恶，维护了魔仙堡的和平。
主角东皇太一（李正翔 配音）是上古神殿的守护者，当上古神殿遭遇入侵时，临危受命带着“天道无极”逃往奥拉星，遭遇重创之后失去记忆，变为萌态亚比，被奥拉星人“兰丁（张安琪 配音）”收留，取名“太二”. 太二（张琦 配音）逐渐适应了奥拉星的生活并认识一些小伙伴，他们发现黑暗势力的阴谋，努力守护奥拉星，过程中，太二也开始恢复记忆，肩负起光复神殿的艰巨使命……
《熊出没之探险日记2》则延续了上一季的剧情，除了保留大家最爱的女性角色赵琳外，还加入了人类大反派“天才威”等新角色，使剧集更具矛盾冲突。
