《萌鸡小队》讲述了四只萌鸡宝宝在妈妈的关爱下，与其他小动物一同快乐相处，共同成长的故事。在遥远的大森林里，有一棵美丽的大树，大树底下被弹性十足的蘑菇和争奇斗艳的花朵包围着，形成了一个宽阔的大自然游乐场，这就是萌鸡们的家。萌鸡妈妈美佳开明又热心，四只萌鸡宝宝（大哥大宇、二姐朵朵、三哥欢欢、小弟麦奇）活泼又可爱。他们互相帮助，四处探险，还结交了很多新朋友，共同描绘出一幅清新童趣的森林画卷，让小朋友们在领略大自然的奥妙的同时，也在萌鸡身上学到许多美好品质。
故事发生在一个名为魔仙堡的魔法世界之中，在这里，魔仙们运用她们所学习到的魔法知识来帮助遇到困难的人们。然而，在这里还是存在着一部分邪恶的魔仙们，她们利用黑魔法来获取利益，破坏世界和平。黑魔仙小月从魔仙小蓝那里偷得了魔仙彩石，这是魔仙们力量的源泉，拥有了魔仙彩石，便可以学习仙界的最高魔法。 带着魔仙彩石，小月躲藏于人类世界之中，为了不让魔仙彩石的力量危害人间，小蓝紧随其后。人类少女凌美琪和凌美雪意外的发现了躲藏在八音盒中的小蓝，三人之间结下了深厚的友谊。小蓝教会了美琪和美雪魔法，两人亦加入了寻找魔仙彩石的队伍中。
威力童子是太阳精华的结晶，太阳让他来到人间，用自己的超级能力为人类的高度文明作贡献。可是他刚诞生，就遭到黑色王国的妖魔－黑风婆和章鱼精的迫害。因为天蝎精一心想要消灭太阳家族，让它的黑色集团统治宇宙，所以对童子的出现怀恨在心。由于威力童子身怀巨大能量，他接连打败了黑风婆和章鱼精，并摧毁了他们的据点－黑风洞和海底魔宫。当他乘胜追击，向宇宙深处的黑色城堡进攻时，却遭到天蝎公主的抵抗。她的掌心雷击具有特殊魔力，使童子屡遭失败。后来从海蚌爷爷那里得知天蝎公主并非天蝎精的女儿，而是童子义姐－采珠的同胞妹妹。于是童子他们就想方设法把真相告诉天蝎公主，谁知天蝎精早已把她的基因全部更换，使她执迷不悟。童子他们又经过千难万险，终于找回了公主的基因，使她恢复人性，姐妹相认了。于是大家同心协力，最后打败天蝎精，消灭黑色王国，让阳光为人类造福。
