新生私立女子校·五棱馆学园背后有着不为人知的一面——由于时空歪曲而出现的谜之妖魔“Oburi”。能与这些人类之敌对抗的，唯有具备能探知五次元空间能力的被作“Striker”的少女们。五棱馆学园同时也是选拔出具备素养的少女们，并养成讨伐Oburi的战斗部队“Fifth Force”的机关。隶属于新结成的队伍“Altair Torte”的五位少女的战斗与友情的物语开幕！
原本期望能成为魔法少女的女主柊舞缇娜，某天突然遇到像吉祥物的生物，获得能变成邪恶组织女干部的能力，并与原本憧憬的魔法少女们对抗。
以沉默的出租车司机「小户川」为主角，故事围绕在他与各种性格古怪的乘客之间，最终将联系到一名高中少女失踪的真相。
安达樱（鬼头明里 配音）是学校里公认的不良少女，常常逃课偷懒。这一天，安达照例翘掉了无聊的体育课，却在体育馆二楼遇见了同样也翘了课的岛村抱月（伊藤美来 配音）。就这样，两个本来并不是太熟的女生开始了她们的交往，两人一起聊天、打保龄球、唱卡拉OK，她们都发现对方的身上有着和自己惊人相似的个性，喜好和对事物的看法也空前的一致。 随着时间的推移，安达发现自己的眼神总是不受控制的锁定在岛村的身上，后者的一举一动竟然能让自己脸红心跳芳心大动，安达明白，自己对岛村怀有的感情早已经超越了友谊。那么，对于两人的关系，岛村是怎么想的呢？
三年前太空飞船猎户号坠毁学园都市，由此引发了严重的惨剧，而该事件也促成宇宙电梯恩底弥翁（Endymion）的建设。在恩底弥翁接近完工的前夕，上条当麻（阿部敦 配音）和茵蒂克丝（井口裕香 配音）揭示了热爱歌唱的少女鸣护亚丽莎。心怀梦想的亚丽莎经过不断的修业和努力，终于得到了试镜的机会，并有可能在恩底弥翁落成的庆祝活动中演唱。这一晚，当麻、茵蒂克丝和亚丽莎在夜归途中遭到史提尔率领的魔法师们的攻击。而学园都市秩序维持部队的介入，无疑标志着魔法侧和科学侧全面战争即将爆发。亚丽莎的体内究竟隐藏着怎样的力量和秘密…… 本片根据镰池和马（创作）、灰村清孝（插画）的轻小说改编。
