金牌得主第二季

工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！

　　初高中一体，让一岐日和（内田真礼 配音）和山下晶（高山优子 配音）、田端爱美（高桥未奈美 配音）再度成为同班同学。当日和考虑是否要加入料理部时，却被Get新技能的夜斗（神谷浩史 配音）附体，由此性情大变，先是在课堂大大咧咧宣言改变形象，尽展女汉子风范，接着又在走廊、校园内卖弄妩媚，派发联系方式，俨然一副夜店女郎做派。随后更冲上绿茵球场，与校队健儿共同挥洒汗水。倒霉的本尊紧随其后，希望夺回身体，无奈都以失败告终。等到了最后，夜斗更在众目睽睽之下做出了令全校师生大为震惊的壮举来。
　　日和的高中生活，就以如此混乱的局面开始了……

　　继53年之后的DCⅡ的故事顺利落下了帷幕之后，如今时间轴再一次回到了最初代的时间之前。芳乃樱是一位元气活泼的小学三年级女生，每天和好友朝仓纯一与白河小鸟一起到风见学园上学，不过在她的身上却有着大家不为人知的秘密……

由于残忍的分尸杀人事件频发，世界各地人民陷入一片惶恐不安之中，然而元凶却是人类未曾意料到的“寄生兽”。这些寄生生物的幼虫侵入人类或动物身体后，以寄生脑部为目标，寄生完成后与脑部细胞同化，管理这个“死掉的身体”。它们能任意变形，能够迅速吸收掌握人类知识，而它们的食物便是寄生体相同的物种。                                                                      　　普通高中生泉新一（岛崎信长 配音）某天被一只奇怪的虫子侵入身体并吞噬了右手，自此他不得不与寄生生物“右”共存。本性正直善良的泉新一不敢将这一变故告诉家人和朋友，然而他喜欢的人村野里美（花泽香菜 配音）似乎留意到他身体的变化。为了被寄生生物杀死的亲友以及所有人类的未来，泉新一决心与其他完全体寄生兽进行殊死搏斗。