东京私立贵大高等学校高一年级的学生弄内洋太追求同学早川然美，正当他准备告白时，却发现然美喜欢的是他的好友——同班同学新舞贵志，于是他陷入了无奈与失落。一个人走在回到家的路上，洋太的情绪十分低落，自己也不知道怎么就走到了一家名叫GOKURAU的出租录影带的商店前。洋太走过一排排录影带架后，在一盒录影带前停了下来：《安慰——天野爱》。借回家的录影带在播放过程中，天野爱居然从画面中走出！爱鼓励洋太要努力追求真爱，并以洋太妹妹的身份住在洋太家中。谁也没有想到，一段感人的恋爱故事就这样开始。
主人公朝仓陆有一天入手了了捷德升华器与奥特胶囊，得到了FUSION RISE(融合上升)变身成捷德奥特曼的力量。与此同时也知道自己继承了堕入邪恶的黑暗巨人贝利亚奥特曼的遗传基因。自己作为在地球长大的普通年轻人，知道了自己其实是贝利亚的儿子。捷德奥特曼，也就是朝仓陆的命运发生了巨大变化。 新的光之巨人！Ultraman Geed奥特曼捷德，诞生！命运，做好觉悟吧。 变身捷德的青年——朝仓陆(饰演：宾田龙臣)，使用神秘的道具Geed Riser及2个蕴藏著奥特曼力量的奥特胶囊Fusion Rise(融合)变身！ 陆性格勇敢，为了成为憧景的「英雄」而全力对抗邪恶。 冲击的事实…人类同伴的基德是继承那个邪恶的奥特曼贝利亚基因的儿子！！ 身上红与黑的配色、尖起的眼睛、胸口利爪的花纹…虽然外貌都有著与贝利亚相似的特征，但是基德是渴望和平及正义的战士。
优等生水谷雫是一个只喜欢学习的女生，性格冷酷，不喜欢惹麻烦，唯一的兴趣是微积分，心中有一个“年收入一千万”的梦想。因为老师答应以新参考书作为报酬，雫才勉强同意送讲义给问题学生——吉田春，而春也是雫的同班同学。正是因为这“送讲义事件”，雫被春误认为成朋友，开始与春有了交集。虽然初次的相处并不愉快，但随着接触的深入，雫发现春其实是一个内心纯洁且渴望朋友的人。这样的两人在一连串的误解中逐渐相互吸引，再加上周围一帮稀奇古怪的损友们，甜蜜又青涩的校园恋爱剧就此拉开序幕。
在死神界有留克的死神追加了讲述月亮的场面。
伊出不登场。
随着夜神总一郎心脏病发作的场面被删除，他在第二次基拉事件时看电视的地方也从医院的病房变成了街头。
月和L的初次见面的地方变更为放映室。
L想到了基拉对第二个基拉的回答。
松田误入松柏集团会议室时做弥撒的地方，从工作间改到搜查本部的房间。
在雷姆消失的场面中，留下雷姆笔记本的描写和月亮拾到笔记本的描写被删除，第三本笔记本的情节全部被省略，与《光环2》相连接。
L的墓前，追加了日本搜查本部的成员宣誓的场面。
部分干部的死因，从心脏麻痹一律改为个别死因。
三堂从建筑物坠落死亡。
纸村伫立在车站的铁轨上，被电车轧死。
奈南川是交通事故。
