被后世称作“魔法少女事变”的，炼金术士卡萝的世界解剖计划被阻止的数周之后。立花响以最大最强的敌人为对手展开格斗，被其压倒在地任凭摆布。面对的威胁——其名为“暑假作业”。作为学生的本分，避无可避的命运残酷到束手无策，无情到无可抗拒。为什么会变成这样呢？心灵仿佛要被碾碎一般，回首过去的响。去了海边。也去了山上。因为与新的朋友们做了约定，以此为理由，充分享受了各处的夏日祭，晚上也像个傻瓜一样大张着嘴仰望烟花。在盂兰盆节离开学生宿舍，回到千叶的老家。久违的家人团聚。
家里由于一场火灾，再加上不负责任的爸爸，使得年仅12岁的南云孝士在一夜之间就变得无家可归、身无分文且无依无靠。饿倒在路边的他，由于一场因缘际会而当上宿舍管理员，然而这间宿舍的房客竟都是女子大学的学生！而且这间宿舍的房客，全都是些异于常人，而且别有隐情的大姐姐！少年宿舍管 理员有点色色的奋斗记，就此开幕。
后藤独是一个极度内向阴沉的女生，因向往乐团活动而开始练习吉他。某天，后藤独在路上被鼓手伊地知虹夏邀请去自己组织的女高中生乐队补缺，于是初相识的后藤、伊地知和山田正式以“纽带乐队”之名开始活动。其后，阳光女生喜多也加入团队，个性鲜明的四个女孩各司其职，乐队准备步入正轨。被大家推举为乐队的原创作品作词的后藤独，渐渐发现难以调和词作中的“乐队风格”与个人风格，为此苦恼不已。经过一番自我探索与朋友的鼓励，原创曲目终于创作完成，后藤独也在意外结识的广井菊里的帮助下再度实现突破，初出茅庐的“纽带乐队”终于迎来了第一次登台表演的机会。没想到演出当日受到台风的影响，直到开场前也只有零散的几位观众到场。在这样沉重的氛围下，纽带乐队开始了他们第一场演出。
小早川流风和流水本来是一对感情很好的双胞胎，而且她们都爱上了田径队的当麻克之学长，可是克之却选择了妹妹流风. 在一次田径队举行的外出旅行中,流风一行人为了避雨而进入了一个山洞, 但是,山洞是一座古墓! 大家闻了其中的气体便一一倒下了。当流风苏醒时却发现只有自己和姐姐流水活了下来, 而且流水的行为变得异常诡异! 原来她们都中了古墓中的病毒，拥有了能自由漂浮和穿越物体的超能力，且能力在月圆时最强。流水与流风感染了两种截然相反的病毒，感染了流水病毒的人会丧失意志成为流水的傀儡，而流风的血可以让他们恢复正常。病毒让流水性情大变，出于嫉妒她坦言流风要让出克之之类的话, 并一次一次的迫害流风。由于流风也有同样的能力, 在紧要关头都能化险为夷。 得知真相的克之打算帮助姐妹俩恢复正常, 丧心病狂的流水却将克之的父母兄弟无情的杀害。流风约流水进行决斗,克之赶来,为化解姐妹俩的仇恨,克之甘愿被流水杀死,在最后关头,流水依旧无法下手,而独自离开...
