钢铁飞龙战队少年们发现在海湾城里，出现了一群名为“捕梦者”的神秘怪兽，它们能够激发出人类内心中诸如自私、嫉妒、恐惧等负面的精神能量，以此来控制人类、强化自身。为了打败“捕梦者”及其背后的主使——外星邪恶势力谬博士，少年们再次召唤杰博士发明的神兵机甲，与“捕梦者”展开一次次较量。在这过程中，大家战胜“心魔”，改掉坏毛病，收获了感悟与成长。
天赋异禀的灵宠师樊凌霄，于甲级门派晋升赛上遭人暗算，被自己的灵鲲所吞噬。睁眼醒来却发现自己已化身为一名叫“流锋芒”的少年，身处白府大牢之中，其门派凌霄阁也走到了绝境。为查明灵鲲反噬真相与重振门派，樊凌霄带着现有的几只灵宠，与谷灵、程曦、月彤，一起踏上了全新的冒险之旅。
辰南一行人离开东褚国，拜师入学神岚学院，协同梦可儿等人共同探寻邪道破灭道的真相，同时辰南自身的身世秘密逐渐浮出水面。
古神之地后，修魔内海永夜魔城一夜崛起，为拓展领地，不断对修魔海周边宗门下手，其中也包括了李慕婉所在云天宗。李慕婉在护门大战中身中奇毒，性命攸关，王林得知此事后，携其再次闯入修魔内海，王林以化神初期修为力战三大城主，名震修魔内海，带回解药救下李幕婉，却发现危机并未解决，千年阴谋浮出水面。最终凭借二人情愫及化神后首次与古神之身合体，联手斩灭魔尊。
