斗罗联邦科考队在极北之地发现了一枚蛋，蛋里孵化出了一个小男孩。科学家夫妇收养了这个身世不明的男孩，为他取名“轩宇”。几年过去，蓝轩宇和养父母一起过着平静的生活。然而武魂蓝银草觉醒后，他身上却出现了越来越多的谜团。
四大宗门之首的玄灵宗，多年来第一次来临水城选拔弟子，方秦两家围绕这一个将决定二者命运的契机，展开明争暗斗。最终，秦南依靠潜心修炼、绝佳天资以及奇遇所得的战神之魂，在使者萧轻雪的公正判罚下，成功扭转颓势战胜方家。进入宗门后，秦南因卷入萧轻雪被逼婚一事，惹来宗主之子欧阳君的仇视。为了不断变强，报答萧轻雪的知遇之恩，秦南屡破强敌，连夺万象大比、外门大比第一、与四大宗门天才共闯武缘阁，并获得搅动大陆的惊天秘密，与冷锋约战生死殿、破北海家围困临水城之难，探索九字真言塔，誓与宗门恶势力战斗到底。
古神之地后，修魔内海永夜魔城一夜崛起，为拓展领地，不断对修魔海周边宗门下手，其中也包括了李慕婉所在云天宗。李慕婉在护门大战中身中奇毒，性命攸关，王林得知此事后，携其再次闯入修魔内海，王林以化神初期修为力战三大城主，名震修魔内海，带回解药救下李幕婉，却发现危机并未解决，千年阴谋浮出水面。最终凭借二人情愫及化神后首次与古神之身合体，联手斩灭魔尊。
妖界覆灭后，妖族在人界流离失所。九宫家将长女九宫良子派往华修国“六十门”留学，暗中收集妖怪并送回太阳岛。王令等人在与九宫良子的相处中，渐渐发现了她和整个九宫家族的真实目的……逆天的仙王大人，这次又要偷偷地为何而战呢？
