大部分的人类，在这个时代里都拥有名为“个性”的力量，但有力量之人却不一定都属于正义的一方。 只要邪恶出现的地方，必定会有英雄挺身而出拯救众人。 一名天生没有力量的少年——绿谷出久从小就憧憬一位顶尖英雄，而他的梦想就是成为伟大的英雄， 可是，没有力量的他能实现自己的梦想吗？ 虽然困难重重，少年却依旧不放弃，朝着自己的目标勇往前进！
199X年，世界被核火吞噬！然而，人类依然设法存活了下来！出现了一名胸前刻有七道伤痕的独行男人，他的名字是健次郎，北斗神拳的继承者。在这个弱肉强食的世界里，健次郎用他的铁拳开拓出一条道路！
初高中一体，让一岐日和（内田真礼 配音）和山下晶（高山优子 配音）、田端爱美（高桥未奈美 配音）再度成为同班同学。当日和考虑是否要加入料理部时，却被Get新技能的夜斗（神谷浩史 配音）附体，由此性情大变，先是在课堂大大咧咧宣言改变形象，尽展女汉子风范，接着又在走廊、校园内卖弄妩媚，派发联系方式，俨然一副夜店女郎做派。随后更冲上绿茵球场，与校队健儿共同挥洒汗水。倒霉的本尊紧随其后，希望夺回身体，无奈都以失败告终。等到了最后，夜斗更在众目睽睽之下做出了令全校师生大为震惊的壮举来。 日和的高中生活，就以如此混乱的局面开始了……
以《最终负荷实验》为名，将Underworld全土卷入的《人界》军与暗之军势的战争。 战局逐渐转变为企图夺取《光之巫女》爱丽丝的《黑暗领域》军加百列一派， 与致力于守护Underworld的《人界》军亚丝娜等人之间的战争。 在桐人仍然沉睡于精神世界的深处之时，《暗黑神贝库达》即加百列 从现实世界中让数万美国玩家登录，企图一举歼灭《人界》军。 相对地，亚丝娜等人利用以Underworld创世神冠名的3个超级账号展开对抗。 获得了《创世神史提西亚》超级账号的亚丝娜， 和《人界》军一同与美国玩家展开死战， 而获得了《太阳神索鲁斯》超级账号的诗乃，则追赶着带走了爱丽丝的加百列。 随后，获得了《地神提拉利亚》超级账号的莉法，也抵达了Underworld。 不仅如此。呼应了莉兹贝特充满气势的演说的《ALO》玩家们， 将千锤百炼的角色进行转移，加入《人界》军一方参战！ 这场大战不只关系到Underworld的存续。 还是赌上了作为究极AI的自律学习型人工智能，甚至人类未来的战斗。 而大战的终点，如今正握在沉睡中的一名少年——《黑色剑士》的手中。 《Alicization》篇，在此完结！
