改编自白石定规原作的同名轻小说，讲述了虽然年纪轻轻，但已经成为魔法使的最高阶的“魔女”的才女伊蕾娜，作为旅人在全世界自由旅行的故事。

　　舞台是2030年的东京。东京近郊一带突然观测到了高频率的共鸣音，同时城市被红雾覆盖。而且，听到这声音的，不论动物还是人类，全都失去了意识。随着首都机能的麻痹，政府暂时将首都机能移往大阪，并预测这一现象为实体不明的病毒，出于对瘟疫的担忧而封锁了东京。但就在这一“大共鸣”发生6天后，失去意识的人们好像什么都没发生过一样地醒来了。之后，封锁都市·东京逐渐取回了城市机能，但以这一天为分界线，各种各样的“异常事件”开始发生，人们开始接连被更进一步的非日常所侵蚀。在此之中，还存在着解放了隐藏在血中的力量、觉醒为“英血之器”的年轻人们——他们被彼此的力量所吸引，不容拒绝地相遇，心灵相通，互相杀害，逐渐被残酷的命运连环所吞噬。

　　伏原（金元寿子 配音）是一名标标准准的社畜，每天都过着在公司里加班到深更半夜的日子。一天，像往常一样独自留在公司加班的她，听到空无一人的办公室里回荡着可怕的声音，内容只有一句，那就是“离去吧”。
　　寻着声音找去，没想到，发出这么可怕的声音的，竟然是一个外表非常可爱的幽灵妹妹（日高里菜 配音），原来，身为幽灵的她，每天都看到伏原在加班，十分担心伏原的身体健康，因此想要以这样的方式来催伏原回家休息。就这样，伏原渐渐的和幽灵妹妹交上了朋友，一人一鬼之间逐渐产生了真挚的友谊。

　　《灼眼的夏娜》TV第二季的故事将从小说第八卷开始讲起，以NDS游戏《灼眼的夏娜DS》中的登场人物，红世之徒，戏睡乡“メア”入侵御崎市开始开篇。据监督渡部高志所说，故事会对第一季的一些伏笔作出解释，并加入不少这个时代的小故事。第二季STAFF和声优会由原班人马担任，“钉宫之誓”依旧强势走高。
　　夏天结束后，新学期开始了
　　许多事物没有任何变化，但是同时也有不少事情逐渐发展着…
　　池和吉田，绪方和田中之间产生了些许微妙的关系
　　还有在我身旁，飘逸着长发的夏娜…
　　但是，这一切似乎有着一丝奇怪的违何感
　　在我们所不知道的地方，红世之徒再次展开了行动…

　　新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节，然而就在同一时间，一名少女出现在他面前。
　　少女为了保护悠二不被法利亚格尼袭击，开始与悠二一同生活。悠二满怀感激向少女道谢，不料少女却如此低喃：“你已经不存在了。”
　　我已经死了？存在丧失者·悠二为何还能够思考呢……

　　玄关门一打开，眼前冒出了一位小学女生——
　　“我依照约定来了，请收我为弟子！”
　　年仅十六岁便拥有将棋界最高头衔“龙王”的九头龙八一家里，出现一位名叫雏鹤爱的小学三年级生，九岁。
　　“什么？……弟子？你在说什么？”
　　“……您不记得了吗？”
　　八一对自己答应过的事情完全没有印象，却展开了与小学女生同居的生活。受到爱直率的热情影响，八一也逐渐取回险些丧失的热忱——