抱持着帮助他人而化身魔法少女，与此同时却必须背负着残酷的命运。在接二连三的战斗中，善良的美树沙耶加（喜多村英梨 配音）彻底耗尽自己的生命。当她的尸体被晓美焰（斋藤千和 配音）和佐仓杏子（野中蓝 配音）带回时，令她的好友鹿目圆（悠木碧 配音）感受到前所未有的悲伤与痛苦。而从丘比（加藤英美里 配音）那里听说到魔法少女的宿命之说，不禁让她受到前所未有的触动。在杏子的建议下，小圆决定救助沙耶加，而她们即将与最强的魔女之夜（水桥香织 配音）碰面。有关魔女的前途与生命，她们走上一条凶险非常的道路……
　　本片为魔法少女的剧场版，分三部上映，由TV版12话重新编集而成。

　　由于过去失败的恋爱经历，橘纯一（前野智昭 配音）封闭起了自己的内心，失去了对于爱情的信心。如今，又一个圣诞节即将到来，想要和女生一起度过这个白色节日的想法忽然占据了橘纯一的脑海，然而，长久没有同异性接触的他已经不知道该如何谈恋爱了。
　　品学兼优，身上永远闪耀着耀眼光芒的绚辻词（名冢佳织 配音）、橘纯一的青梅竹马，有些天然呆的樱井梨穗子（新谷良 配音）、外冷内热，体育方面格外出色的七咲逢（野上尤加奈 配音）、大大咧咧，个性爽朗的棚町薫（佐藤利奈 配音）、知书达理温文尔雅的软妹子中多纱江（今野宏美 配音）和校园中人人仰慕的女神森岛遥（伊藤静 配音），当这些女孩子们接二连三地出现在橘纯一的身边时，他会做出怎样的选择呢？

　　结城梨斗（渡边明乃 配音）是一位平凡的高中生，暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里 配音），然而，腼腆的梨斗决心将这份真挚地感情深深埋藏在心底，每日只是在角落里偷偷地凝望着自己的女神。
　　某日，一位名叫菈菈·萨塔琳·戴比路克（户松遥 配音）的外星女王突然从天而降，成为了梨斗的同居人，就这样，梨斗开始了和菈菈一起的没羞没臊地生活。金色暗影（福圆美里 配音）本是为了暗杀梨斗而来的宇宙第一杀手，却莫名其妙地留在了地球，为了让金色暗影重新返回杀手界，黑咲芽亚（井口裕香 配音）被派出来到了梨斗的身边，这一次，又会有怎样有趣的故事发生呢？

　　半年前的一连串遭遇，彻底改变了三年级小学生高町奈叶（田村由香里 配音）的人生，她以魔法少女的身份邂逅了可爱的小伙伴尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰），并通过连番激战与深锁着无数秘密和烦恼的菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）成为莫逆好友。新学期开始，菲特以小学生的身份转入奈叶的班级，一切看似进入了平稳期。克就在某个毫无征兆的夜晚，奈叶和菲特遭到手持暗之书的维塔（真田麻美 配音）等三名违法渡行者的袭击，她们的魔导器也被破坏。
　　新的危机，新的对手，一切朝着不可预知的方向发展……

　　市立见泷原中学，又迎来平静祥和的一天。就读于二年级的女孩鹿目圆（悠木碧 配音）和朋友美树沙耶加（喜多村英梨 配音）、志筑仁美（新谷良子 配音）尽情讨论恋爱的话题，享受少女的快乐青春。这时班上转来了名叫晓美焰（斋藤千和 配音）的新生，这个带着些许神秘气质的女孩让小圆颇感疑惑。与沙耶加下学回家路上，小圆听到呼救声，声音来自一只浑身伤痕累累的未知生物，而追杀它的正是晓美焰。危急时刻，她们得到同为见泷原中学学生的魔法少女巴麻美（水桥香织 配音）的帮助，进而得知那只名叫丘比的生物有能够帮助人变成魔法少女的能力。少女们无意间开启了通往另一个世界的大门……
　　本片为魔法少女的剧场版，分三部上映，由TV版12话重新编集而成。

　　明日香（能登有沙 配音）是一个性格十分“天然”的特别女孩，她就读于初中三年级，无论是上学路上，还是在学校里，明日香经常会做出让人意想不到的天然萌举动、说出让人无法招架的话。加上长相甜美可爱，身材姣好，她所到之处都会卷起一股“明日香”之风，令周围的男性心花怒放。出场人物还有明日香的摄影师爸爸，以及同校的学妹等角色，明日香独特的个性也影响到身边人。
　　本动画改编自森泰士作漫画作品《天然萌少女明日香》。

　　个性开朗心底单纯的喜屋武七叶（与那岭里都 配音）、沉着冷静不失温柔但生气起来会非常恐怖的喜屋武七绪（松田瑠华 配音）和拥有着极强灵感应能力的喜屋武心七是感情十分要好的三姐妹，三人同奶奶一起过着相依为命的生活。
　　一次偶然中，七夜发现了一个神奇的瓶子，并且在误打误撞之中将瓶子打开，外表稚嫩可爱嘴巴却超级毒舌的妮娜（松嵜丽 配音）、大大咧咧傻乎乎却惹人怜爱的拉娜（井之上奈奈 配音）和沉默寡言面无表情的卡娜（东城日沙子 配音）三个被封印已久的精灵出现了。就这样，喜屋武家多了三名家庭成员，平静的日常生活也离三姐妹越来越远。

　　故事发生在箱庭学园，黑神目泷（丰崎爱生 配音）是学园一年级的新生，作为学校里的学生会长，黑神拥有完美的外表，优异的成绩，强健的身体和丰厚的家底，如此完美的女神，在生机勃勃的校园里会遇见怎样有趣的故事呢？
　　人吉善吉（小野友树 配音）是黑神的青梅竹马，两人从小玩到大，彼此之间感情十分要好。作为支持率百分之九十八的学生会长，黑神联手人吉善吉设置了“意见箱”，同好友阿久根高贵（浪川大辅 配音）、喜界岛枫夏（芽野爱衣 配音）等人一起，解决校园中的各类疑难杂症。然而，随着黑神的势力越来越大，一些不友好的声音随之而来。