远古时代，掌管古世界的邪恶魔石「DB」在现代的这个世界上，再度的苏醒了！！为了要拯救全人类，神明派了一位使者来到世上，而且是个能够使用圣石「RAVE」的少年！ 居住在车库岛的哈鲁，与姊姊凯特蕾雅一同过着平静的生活。但是自从偶然钓起一只不明生物——普鲁之后，身边便发生了一连串的事件。为了找寻真相，哈鲁决定离开小岛，前往未知的世界……
自从人类的和平与幻想被超大型巨人打破的那天起，艾伦·耶格尔便每天持续着没有尽头的战斗。因为眼睁睁地看着无力抵抗的母亲被巨人吃掉，艾伦发誓要将世间的巨人一只不留地驱逐出去。但是，在严酷的战斗中，艾伦自己也变成了巨人。为了人类的自由，艾伦施展着巨人的力量，并在希娜之墙的史托黑斯区和女巨人发生了激烈的冲突。在这场巨人间的战斗中，艾伦最终胜出了。即便如此，艾伦以及人类的休息时刻也不会到来。下一轮的战斗已经宣告开始。对于逼近罗塞之墙的巨人大群，人类将如何面对？
2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。
