被称为“红色彗星”基恩公国军的王牌飞行员,‘势’和他的妹妹敲定了《塞拉·玛斯’的命运悲剧的开始和过去~两兄妹的流转的故事背景,边路~3掌握实权,基恩公国,统帅ザビ家,ランバ・ラル和黑色三连星等“一年战争”中活跃了无数的基恩军队著名的跳蛙王牌飞行员们年轻的日的英勇,战况戏剧性地改变了人型机动武器开发“出”的轶事,与地球联邦军的分歧和对开战的路线等，作为映像第一次被描写“一年战争”以前的过去的故事。
赌上两人份的人生，他们有想要实现的伟大梦想！ 日本在世界上属于花式滑冰强国，而就只有一小部分的选手能够参加以世界级水准互相竞争的全日本锦标赛。圆梦失败的青年．明浦路司与不被所有人看好的少女结束祈，对于滑冰，这两个人都拥有着无人能比的强烈执着。 在冰上相遇的他们组成了搭档，目标是成为花式滑冰世界级强者！
公元2307年，地球的化石燃料枯竭了。经过将近半个世纪的建设后，建成了全长5万千米、以3条轨道升降机为中心的太阳能发电系统。为了建造出这个能制造半永久能量的巨大建筑物，世界形成了3个巨大的国家联盟：以美国为中心的“世界经济联盟”，通称UNION；以中国、俄罗斯、印度为中心的“人类革新联盟”；新欧洲共同体AEU。由于轨道升降机过于巨大，防卫变成了十分困难的任务。但各国军队依然为了自己的威信与繁荣进行着大规模的zero-sum game（任何一方都得不到好处的竞争）。这样的世界，要为其花上句号的组织出现了——拥有机动战士高达的“天人”私人武装组织。他们为了消除世界的纷争，展开了超越民族、国家、宗教的作战行动。高达驾驶员刹那•F•清英决心改变这个世界。
在清洁公司工作的日比野卡夫卡，因与日本防卫队的希望之星一青梅竹马的亚白米娜重逢，重燃曾经放弃的防卫队梦想。然而，就在此时，他却意外变身为拥有强大力量的“怪兽8号”。在后辈市川莱诺的帮助下，卡夫卡一边隐藏真实身份，一边参加防卫队选拔考试。然而，在生活似乎步入正轨时，一场由高智商怪兽发起的防卫队基地袭击事件，彻底打破了平静。
为了书可以去做巫女！ 「比起一日三餐更喜欢书」的女大学生·本须丽乃转生成为士兵的女儿·梅茵的那个世界中，并没有书。 平民的识字率低下，羊皮纸做出来的书十分昂贵，是贵族老爷专属的东西。 于是梅茵做了一个决定。 “没有书的话，自己做出来不就行了” 在历经了各种失败之后，梅茵遇到了商人班诺，为了成为见习商人而完成了植物做的纸，但此时梅茵的身体却遭到「身蚀的发热」所侵蚀。 在贵族拥有魔力的这个世界中，偶尔会有带着魔力出生的平民。那即是「身蚀」。若没有用来吸取持续增长的魔力的魔术具，就会不久于人世。 此时，在洗礼式上发现了神殿图书室的梅茵，向神殿长提出直接谈判，想要成为见习巫女。一番争论过后，梅茵终于成为奉纳魔力的青衣见习巫女。 但原本赋予贵族的「青衣」由平民出身的梅茵穿上，招致许多人的不快，梅茵的下一步前途多难。 尽是问题儿童的侍从，神殿的阶级社会……。 与丽乃时代、下町时代有所不同的神殿的常识摆在梅茵面前。梅茵能够尽情读书的日子究竟会不会到来！？ 还有，梅茵能否顺利制造出书！？
本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。 同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。 在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
