《饼干警长》故事发生在一个神奇的食品王国，王国里居住着各种各样的饼干人，他们单纯而善良，快乐地生活着，不按常理出牌的饼干警长与慢性子助手曲奇警员是王国的守护者，他们与妄图夺取王国统治权的霉脸大盗一伙斗争到底，在饼干城里展开了一系列有趣的警匪故事。
故事围绕多个角色的情感纠葛与家族矛盾展开，主要情节包括宇浩与梦媛的童年回忆与情感冲突、刘奶与晴天的收留与矛盾、以及梦媛母为利益干涉子女关系等复杂人际关系。剧中包含大量家庭伦理、爱情和商战元素，人物关系错综复杂。
