小新今年5岁了，不要以为他是那种懵懂无知的小孩，他其实人小鬼大，喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗——小白，还经常讲些无厘头的黄色笑话。小新的妈妈美伢是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经常被小新捉弄得七窍生烟，爸爸野原亦经常被这两母子搞得晕头转向。《蜡笔小新》的作者以一个5岁小童的眼光，40岁的成年人的心态去观察这个大千世界，看到了许多光怪陆离的景象，小新一家的幽默故事亦由此产生。
在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
结城梨斗（渡边明乃 配音）尽管沉默寡言，但拥有一颗温柔善良的内心。内向的他暗恋名叫西连寺春菜（矢作纱友里 配音）的女孩，然而，他选择了把真挚的感情藏在心底，只是偷偷看着她已解相思之苦。 终于，梨斗再也无法抑制内心的感情，他鼓起勇气，决定向春菜告白，然而，一连串意外的发生让他的告白对象变成了名为菈菈（户松遥 配音）的女子，更加匪夷所思的是，菈菈的真实身份竟然是戴比路克星的外星公主。就这样，梨斗开始了和菈菈“斗智斗勇”的生活，随之而来的不仅仅是接踵而至的各路麻烦，竟然还有尾随菈菈而来的危险外星杀手，面对这样的险境，梨斗还能愉快的玩耍吗？
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
